从PCR实验室净化中来看，有害气体输出系统的工程结构中不难看出，控制PCR实验室净化中的废气的来源非常重要。根据工艺流程和废气产生原理进行如下布控。
（1）使用通用排气罩和悬挂式排气罩作为个排气输出可控系统装置；
（2）使用原子吸收罩和悬挂式排气罩作为第二个排气输出可控系统装置；
（3）使用测试设备通风柜（也称为毒气柜）作为第三种废气输出可控系统设备；
（4）将有一个用于挥发性存储系统的挥发性存储柜，作为第四种废气输出可控装置；
（5）温控净化空气供应装置用作PCR实验室净化的空气供应系统的可控制装置。然后将5台设备连接到计算机网络，并通过有害气体输出系统的智能自动控制中心将其均匀排放。
其PCR实验室净化的消毒方式除了紫外线照射、净化空气送风以外，可以在本次使用结束以后，以及下次使用之前，用消毒液擦拭。一般不采用臭氧消毒的方式。
通常，实验中的污染物来源是多种多样的，每种预防方法的性能都有自己的优势，针对不同的污染源正确地选择预防的方式，并将各种消毒方式与PCR实验室净化结合使用，各取所长，才能有效地达到预防实验污染的目的。如果只重视实验前的污染物去除，忽视了实验过程中的污染物，错误地使用甚至不使用空气净化装置，就不能达到实验所要求的PCR实验室净化条件，增加实验中污染的危险。
PCR实验室通常采用非单向流送风方式，所谓非单向流，指气流流线方向不平行，风速也不一致。PCR实验室一般采用上送下回式。上部送风依靠送风口进入房间，下部回风依靠每个房间的对称分布的排风柱下部的排风口排风。
新风从室外进入处理机组，经过粗效、中效、亚、表冷(热)段、喷淋段(加湿)几个处理过程，然后进入洁净室
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